A História
O jogo acontece no ano 8643. Você joga como Capitão Linessa Star,
Comandante da Colônia de Repopulação: Deep Six Nine. Seis. Nove é uma colônia na galáxia entre muitos que foram fundados pela Federação. A Federação é responsável por ajudar as espécies Xeno que estão em perigo de extinção, ajudando-as a reproduzir.

A Federação atinge esse objetivo utilizando tecnologia genética que permite aos membros da Federação,
para ficar impregnado por (ou para impregnar) membros de diferentes espécies. Como capitão do Deep Six Nine, é seu dever formar laços com outras espécies Xeno,
e recrutar seu povo para sua colônia para participar de seus esforços de criação. A história acontece após um incidente ocorrido com a Capitã Linessa Star em que ela,
tinha inesperadamente retornado de uma missão de construção de relacionamento de um ano com muitas de suas memórias apagadas. Sem saber o que lhe aconteceu, ela quer descobrir quem ela é,
o que aconteceu com ela, e como ela pode reconstruir sua colônia que caiu em desordem em sua ausência. Você desbloqueará mundos diferentes para explorar dentro da galáxia para visitar para recrutar Xenos,
em sua colônia e descobrir o mistério por trás de suas memórias perdidas.